MAXScanner জীববিজ্ঞান ও ল্যাব ক্যালকুলেটর
qPCR দক্ষতা ক্যালকুলেটর — স্ট্যান্ডার্ড কার্ভ, ঢাল, R² ও রেসিডুয়াল
ঢাল থেকে qPCR অ্যামপ্লিফিকেশন দক্ষতা হিসাব করুন, অথবা টেমপ্লেটের বিপরীতে Ct/Cq-এর পূর্ণ স্ট্যান্ডার্ড কার্ভ ফিট করুন। ঢাল, ইন্টারসেপ্ট, R², দক্ষতা, অ্যামপ্লিফিকেশন ফ্যাক্টর ও প্রতিটি বিন্দুর রেসিডুয়াল পান।
আপনার স্ট্যান্ডার্ড-কার্ভ মেলান
প্রতি স্ট্যান্ডার্ডের জন্য একটি সারি: টেমপ্লেটের পরিমাণ, Ct/Cq। পরিমাণ কপি, ঘনত্ব বা আপেক্ষিক পরিমাণ হতে পারে, তবে একটি সামঞ্জস্যপূর্ণ স্কেলে থাকতে হবে।
ঢাল → দক্ষতার দ্রুত সমাধান
সূত্র: E% = (10^(-1/slope) - 1) × 100। মানের সীমাগুলোকে অ্যাসের প্রেক্ষাপটের নির্দেশনা হিসেবে ধরুন, আপনার প্রোটোকল বা যাচাইয়ের মানদণ্ডের বিকল্প হিসেবে নয়।
বিন্দু-বিন্দু অবশিষ্টের নিরীক্ষা
| পরিমাণ | log₁₀ পরিমাণ | মাপা Ct/Cq | পূর্বাভাসিত | অবশিষ্ট |
|---|---|---|---|---|
| 1000000 | 6.0000 | 15.2 | 15.200 | -0.000 |
| 100000 | 5.0000 | 18.5 | 18.500 | 0.000 |
| 10000 | 4.0000 | 21.8 | 21.800 | 0.000 |
| 1000 | 3.0000 | 25.1 | 25.100 | 0.000 |
| 100 | 2.0000 | 28.4 | 28.400 | 0.000 |
এই স্ট্যান্ডার্ড-কার্ভ ক্যালকুলেটর কীভাবে কাজ করে
প্রতিটি স্ট্যান্ডার্ডের টেমপ্লেট-পরিমাণ ও মাপা Ct/Cq পেস্ট করুন। ক্যালকুলেটর প্রতিটি ধনাত্মক টেমপ্লেট-পরিমাণের log₁₀ নেয়, একটি সাধারণ লঘিষ্ঠ বর্গ রেখা ফিট করে, তারপর তার ঢাল থেকে অ্যামপ্লিফিকেশন দক্ষতা বের করে। শুধু ঢাল দেখানো উইজেটের মতো নয়, এটি R², ইন্টারসেপ্ট, অনুমিত Ct/Cq ও প্রতিটি রেসিডুয়াল দৃশ্যমান রাখে, যাতে একটি শিরোনাম-শতাংশে ভরসা না করে কার্ভটি নিজেই খুঁটিয়ে দেখতে পারেন।
কাজে লাগার মতো ওয়ার্কফ্লো
সিরিয়াল ডাইলিউশন ক্যালকুলেটর দিয়ে স্ট্যান্ডার্ডের পরিকল্পনা করুন, প্রয়োজনে DNA ঘনত্বকে আণবিক কপি-সংখ্যায় রূপান্তর করুন, তারপর মাপা স্ট্যান্ডার্ড সিরিজ এখানে পেস্ট করুন। সব টেমপ্লেট-পরিমাণে একক একই রাখুন।
সচরাচর জিজ্ঞাসিত প্রশ্ন
ঢাল থেকে qPCR দক্ষতা কীভাবে হিসাব করা হয়?
দক্ষতা = (10^(-1/slope)-1)×100%। ঢাল প্রায় -3.322 হলে অ্যামপ্লিফিকেশন দক্ষতা মোটামুটি 100%।
আমার ডাইলিউশন সিরিজ থেকে কি ঢাল ও R² হিসাব করা যায়?
হ্যাঁ। অন্তত তিন জোড়া টেমপ্লেট-পরিমাণ ও Ct/Cq পেস্ট করুন। ক্যালকুলেটর ধনাত্মক টেমপ্লেট-পরিমাণের log10 নেয় এবং সাধারণ লঘিষ্ঠ বর্গ পদ্ধতিতে log10(টেমপ্লেট)-এর বিপরীতে Ct/Cq ফিট করে।
রেসিডুয়াল দেখানো হয় কেন?
রেসিডুয়াল দেখায় প্রতিটি মাপা Ct/Cq ফিট করা স্ট্যান্ডার্ড কার্ভ থেকে কতটা দূরে, ফলে অস্বাভাবিক কোনো ডাইলিউশন-বিন্দু লুকিয়ে না রেখেই সহজে চোখে পড়ে।