MAXScanner Rechner für Biologie & Labor
PCR-Annealing-Temperatur-Rechner — Primerpaar, ΔTm & Gradientenbereich
Schätzen Sie einen praxisnahen Ausgangswert für die PCR-Annealing-Temperatur anhand der Tm-Werte von Forward- und Reverse-Primer, markieren Sie nicht zueinander passende Primerpaare und erzeugen Sie einen Gradientenbereich für die empirische Optimierung.
Zuletzt aktualisiert: 2026-09-17
Ergebnisse
Formel, Beispiel und Annahmen
Start-Ta≈niedrigere Primer-Tm−5 °C; Gradient um den Startwert dargestellt.
Bei Primern mit 60 °C und 61 °C Tm ist ein Start-Annealing-Wert von 55 °C mit einem nahegelegenen Gradienten ein sinnvolles erstes Experiment.
- Die Annealing-Temperatur hängt vom Protokoll und der Polymerase ab; die Herstellerangaben haben Vorrang.
- Das Ergebnis ist ein Ausgangspunkt für die empirische Optimierung, keine Garantie für Amplifikationsspezifität oder Ausbeute.
Häufig gestellte Fragen
Warum wird die niedrigere Primer-Tm verwendet?
Ein gemeinsamer Annealing-Schritt muss beiden Primern die Bindung ermöglichen; eine einfache Ausgangsregel orientiert sich daher am thermisch weniger stabilen Primer.
Was tun, wenn sich die Primer-Tm-Werte stark unterscheiden?
Ein großes ΔTm ist ein Konstruktionshinweis. Statt einer Kompromisstemperatur zu erzwingen, sollten Sie das Primerpaar neu entwerfen und experimentell überprüfen.