MAXScanner Rechner für Biologie & Labor
Primer-Tm-Rechner — Schmelztemperatur, GC-Gehalt & Primerpaar-Prüfung
Schätzen Sie die Schmelztemperatur von DNA-Primern anhand der Sequenz, vergleichen Sie Forward- und Reverse-Primer, prüfen Sie GC-Gehalt und ΔTm und sehen Sie die verwendete Berechnungsmethode.
Zuletzt aktualisiert: 2026-09-17
Ergebnisse
Formel, Beispiel und Annahmen
Kurze Oligos: Tm≈2(A+T)+4(G+C). Längere Oligos: Tm≈64,9+41·(GC−16,4)/N.
Ein 20-Basen-Primer mit ausgewogenem GC-Gehalt liegt typischerweise nahe dem Temperaturbereich, der als Ausgangspunkt für die routinemäßige PCR-Optimierung dient.
- Dies ist eine didaktische Planungsschätzung; Puffer-Chemie und Polymerase-Systeme können die experimentelle Tm verschieben.
- Für sequenzkritische Arbeiten vergleichen Sie das Ergebnis mit einem Nearest-Neighbor-Rechner unter Berücksichtigung Ihrer tatsächlichen Ionen- und Oligokonzentrationen.
Häufig gestellte Fragen
Warum weichen Primer-Tm-Rechner voneinander ab?
Sie können unterschiedliche thermodynamische Modelle, Salzkorrekturen, Oligokonzentrationen und Pufferannahmen verwenden. Vergleichen Sie daher die Methode und die Bedingungen, nicht nur den Endwert.
Sollte ein 5'-Klonierungs-Overhang berücksichtigt werden?
Für die Erstzyklus-Anlagerung sollten Sie den template-bindenden Bereich separat bewerten, da ein nicht anlagernder Overhang sich anfangs nicht mit der Matrize paart.