MAXScanner Biologie- & Laborrechner
Rechner für DNA-Kopienzahl — ng/µL, bp, Kopien/µL & qPCR-Kopien
Rechnen Sie die Massenkonzentration von dsDNA oder ssDNA und die Fragmentlänge in Moleküle pro Mikroliter, Gesamtmoleküle und qPCR-Templatkopien pro Reaktion um. Optional überschreibt ein exaktes Molekulargewicht die Schätzung über Basenpaare.
Ergebnisse
Formel, Beispiel und Annahmen
MW≈Länge×660 g/mol für dsDNA bzw. ×330 g/mol für ssDNA; Kopien/µL=(ng/µL×10⁻⁹/MW)×Nₐ; Kopien/Reaktion=Kopien/µL×Template-µL.
Ein dsDNA-Amplikon mit 150 bp bei 10 ng/µL enthält etwa 6,08×10¹⁰ Moleküle/µL; die Zugabe von 2 µL liefert etwa 1,22×10¹¹ Template-Moleküle.
- 660 bzw. 330 g/mol pro Base sind mittlere Planungsnäherungen; verwenden Sie bei Verfügbarkeit das exakte Molekulargewicht des Herstellers.
- Die Kopienzahl ist eine Umrechnung der Molekülanzahl und keine Vorhersage der qPCR-Amplifikationseffizienz oder des gemessenen Ct-/Cq-Werts.
Häufig gestellte Fragen
Verwendet zirkuläre Plasmid-DNA eine andere Formel für das Molekulargewicht?
Die Topologie ändert die Umrechnung über Basenpaare nicht wesentlich. Verwenden Sie die volle Plasmidlänge und das Molekulargewicht für dsDNA, sofern kein exaktes Molekulargewicht vorliegt.
Wie berechne ich die Kopien pro qPCR-Reaktion?
Berechnen Sie zuerst die Kopien pro Mikroliter aus Konzentration und Fragmentlänge und multiplizieren Sie das Ergebnis dann mit dem Volumen des Templats, das einer Reaktion zugegeben wird.