Calculateur de biologie et de laboratoire MAXScanner
Calculateur de nombre de copies d'ADN — ng/µL, pb, copies/µL et copies qPCR
Convertissez la concentration massique d'ADN double ou simple brin et la longueur des fragments en molécules par microlitre, nombre total de molécules et copies de matrice qPCR par réaction. La masse moléculaire exacte facultative remplace l'estimation par paire de bases.
Résultats
Formule, exemple et hypothèses
MW≈longueur×660 g/mol pour l'ADN double brin ou ×330 g/mol pour l'ADN simple brin ; copies/µL=(ng/µL×10⁻⁹/MW)×Nₐ ; copies/réaction=copies/µL×volume de matrice en µL.
Un amplicon d'ADN double brin de 150 pb à 10 ng/µL contient environ 6,08×10¹⁰ molécules/µL ; l'ajout de 2 µL apporte environ 1,22×10¹¹ molécules de matrice.
- Les valeurs de 660 et 330 g/mol par base sont des approximations moyennes de planification ; utilisez la masse moléculaire exacte du fournisseur lorsqu'elle est disponible.
- Le nombre de copies est une conversion en nombre de molécules, et non une prédiction de l'efficacité d'amplification qPCR ni d'un Ct/Cq mesuré.
Questions fréquentes
L'ADN plasmidique circulaire utilise-t-il une formule de masse moléculaire différente ?
La topologie ne modifie pas sensiblement la conversion masse-paire de bases. Utilisez la longueur complète du plasmide et la masse moléculaire de l'ADN double brin, sauf si vous disposez d'une masse moléculaire exacte.
Comment obtenir le nombre de copies par réaction qPCR ?
Calculez d'abord les copies par microlitre à partir de la concentration et de la longueur du fragment, puis multipliez par le volume de matrice ajouté à une réaction.