Calculateurs de biologie et de laboratoire MAXScanner
Calculateur de Tm d'amorce — Température de fusion, % GC et vérification de paire d'amorces
Estimez la température de fusion (Tm) d'une amorce d'ADN à partir de sa séquence, comparez les amorces sens et antisens, examinez la teneur en GC et le ΔTm, et consultez la méthode de calcul utilisée.
Dernière mise à jour : 2026-09-17
Résultats
Formule, exemple et hypothèses
Oligos courts : Tm≈2(A+T)+4(G+C). Oligos plus longs : Tm≈64,9+41·(GC−16,4)/N.
Une amorce de 20 bases à teneur en GC équilibrée se situe généralement dans la plage de températures utilisée comme point de départ pour l'optimisation de routine d'une PCR.
- Il s'agit d'une estimation de planification à visée pédagogique ; la composition du tampon et le système de polymérase peuvent modifier la Tm expérimentale.
- Pour les travaux où la séquence est critique, comparez avec un calculateur du plus proche voisin en tenant compte de vos concentrations réelles en ions et en oligos.
Questions fréquentes
Pourquoi les calculateurs de Tm d'amorces donnent-ils des résultats différents ?
Ils peuvent utiliser des modèles thermodynamiques différents, des corrections de sel, des concentrations en oligos et des hypothèses de tampon distinctes. Comparez la méthode et les conditions, et pas seulement le résultat final.
Faut-il inclure une extension 5′ de clonage ?
Pour l'amorçage du premier cycle, évaluez séparément la région de fixation sur la matrice, car une extension qui ne s'hybride pas ne s'apparie pas initialement à la matrice.