MAXScanner 生物・実験室計算機
PCR アニーリング温度計算機 — プライマーペア・ΔTm・グラジエント範囲
フォワードとリバースのプライマーのTm値から、PCRのアニーリング温度の実用的な出発点を推定します。Tmが大きく異なるプライマーペアを示し、実験的な最適化のためのグラジエント範囲を作成します。
最終更新: 2026-09-17
計算結果
0 °C を超えるプライマーのTm値を両方入力してください
計算式・計算例・前提条件
開始Ta≈低い方のプライマーのTm−5 °C。開始推定値の周辺にグラジエント範囲を表示します。
Tmが60 °Cと61 °Cのプライマーの場合、アニーリング温度の開始推定値55 °Cとその近傍のグラジエントで実験すると、最初の検討として有用です。
- アニーリング温度はプロトコルやポリメラーゼに依存します。メーカーの推奨条件を優先してください。
- この結果は実験的な最適化の出発点であり、増幅の特異性や収量を保証するものではありません。
よくある質問
低い方のプライマーのTmを基準にするのはなぜですか?
共通のアニーリング工程では両方のプライマーが結合できる必要があります。そのため、簡便な出発点のルールとして、熱的に安定性の低い方のプライマーを基準にします。
プライマーのTm値が大きく異なる場合はどうすればよいですか?
ΔTmが大きい場合は設計上の警告です。無理に中間の温度に合わせるのではなく、プライマーペアを設計し直し、実験で確認することを検討してください。