MAXScanner 生物・実験室計算機
プライマー Tm 計算機 — 融解温度・GC含量・プライマーペアの確認
DNAプライマーの配列から融解温度(Tm)を推定し、フォワードとリバースのプライマーを比較して、GC含量とΔTmを確認します。計算方法も表示します。
最終更新: 2026-09-17
計算結果
フォワードTm 53.83 °C
フォワードGC含量 55%
フォワード長 20 nt
計算式・計算例・前提条件
短いオリゴ: Tm≈2(A+T)+4(G+C)。長いオリゴ: Tm≈64.9+41·(GC−16.4)/N。
GC含量がバランスの取れた20塩基のプライマーは、通常のPCR最適化の出発点として使われる温度範囲付近になるのが一般的です。
- これは教育・計画用の推定値です。緩衝液の組成やポリメラーゼの種類によって、実験でのTmは変化する場合があります。
- 配列の正確さが重要な作業では、実際のイオン濃度およびオリゴ濃度を入力した最近接塩基対法の計算機と比較してください。
よくある質問
プライマーのTm計算機によって結果が違うのはなぜですか?
計算機によって、熱力学モデル、塩補正、オリゴ濃度、緩衝液の前提条件が異なる場合があります。最終的な数値だけでなく、計算方法と条件を比較してください。
5′末端のクローニング用タグは計算に含めるべきですか?
最初のサイクルでのプライマー結合を評価するには、テンプレートに結合する領域を別に検討してください。アニーリングしない配列のタグは、最初はテンプレートと対合しないためです。