MAXScanner Biologie- & Laborrechner
Rechner für DNA-Ligation — Insert:Vektor-Molverhältnis, ng, fmol & Pipettiervolumen
Berechnen Sie die benötigte Insert-DNA-Masse aus den Längen von Vektor und Insert, vergleichen Sie das tatsächliche Molverhältnis Insert:Vektor, rechnen Sie beide Fragmente in Femtomol um und ermitteln Sie optional Pipettiervolumina aus Stammlösungskonzentrationen.
Ergebnisse
Formel, Beispiel und Annahmen
Ziel-Insert ng=Vektor ng×(Insert bp/Vektor bp)×Zielverhältnis; dsDNA fmol=ng×10⁶/(bp×660).
Mit 50 ng eines 3.000-bp-Vektors und eines 1.000-bp-Inserts benötigt ein Molverhältnis von 3:1 genau 50 ng Insert.
- Die Massenverhältnis-Gleichung setzt voraus, dass beide Fragmente doppelsträngige DNA sind.
- Ein sinnvolles Molverhältnis hängt von Assembly-Chemie, Endtyp, Fragmentdesign und Protokoll ab; der Rechner liefert nur die Rechnung und schreibt keine Laborbedingung vor.
Häufig gestellte Fragen
Warum ein Molverhältnis statt gleicher DNA-Masse?
Bei der Ligation werden Moleküle verbunden. Kurze Fragmente enthalten bei gleicher Masse mehr Moleküle als lange, daher muss die Fragmentlänge berücksichtigt werden.
Kann dieser Rechner auch Pipettiervolumina berechnen?
Ja. Geben Sie die Stammkonzentrationen von Vektor und Insert ein, um die berechneten Nanogramm-Mengen in Mikroliter umzurechnen.