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Calculateur de ligature d'ADN — Ratio molaire insert:vecteur, ng, fmol et volumes de pipetage

Calculez la masse d'ADN d'insert nécessaire à partir des longueurs du vecteur et de l'insert, comparez le ratio molaire insert:vecteur réel, convertissez les deux fragments en femtomoles et, si vous le souhaitez, calculez les volumes de pipetage à partir des concentrations des solutions mères.

Résultats

Saisir une longueur de vecteur, une longueur d'insert, une masse de vecteur et un rapport cible positifs

Formule, exemple et hypothèses

ng d'insert cible=ng de vecteur×(pb insert/pb vecteur)×ratio cible ; fmol ADN double brin=ng×10⁶/(pb×660).

Avec 50 ng d'un vecteur de 3 000 pb et un insert de 1 000 pb, un ratio molaire cible de 3:1 nécessite 50 ng d'insert.

  • L'équation du ratio massique suppose que les deux fragments sont de l'ADN double brin.
  • Un ratio molaire utile dépend de la chimie d'assemblage, du type d'extrémités, de la conception des fragments et du protocole ; le calculateur fournit un calcul arithmétique et ne prescrit pas de condition de laboratoire.

Questions fréquentes

Pourquoi utiliser un ratio molaire plutôt qu'une masse d'ADN égale ?

La ligature assemble des molécules. À masse égale, les fragments courts contiennent plus de molécules que les longs ; la longueur des fragments doit donc être prise en compte.

Ce calculateur peut-il calculer des volumes de pipetage ?

Oui. Saisissez les concentrations des solutions mères du vecteur et de l'insert pour convertir les quantités calculées en nanogrammes en microlitres.

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