Calculateur de biologie et de laboratoire MAXScanner
Calculateur d'efficacité qPCR — Courbe standard, pente, R² et résidus
Calculez l'efficacité d'amplification qPCR à partir d'une pente ou ajustez une courbe standard complète Ct/Cq en fonction de la quantité de matrice. Obtenez la pente, l'ordonnée à l'origine, le R², l'efficacité, le facteur d'amplification et les résidus point par point.
Ajustez votre courbe étalon
Une ligne par étalon : quantité du modèle, Ct/Cq. La quantité peut être un nombre de copies, une concentration ou une quantité relative, mais elle doit rester sur une échelle unique et cohérente.
Calcul rapide : pente → efficacité
Formule : E% = (10^(-1/pente) - 1) × 100. Considérez les seuils de qualité comme des repères propres au contexte de dosage, et non comme un substitut à votre protocole ou à vos critères de validation.
Audit des résidus point par point
| Quantité | log₁₀ quantité | Ct/Cq mesuré | Prédit | Résidu |
|---|---|---|---|---|
| 1000000 | 6,0000 | 15,2 | 15,200 | -0,000 |
| 100000 | 5,0000 | 18,5 | 18,500 | 0,000 |
| 10000 | 4,0000 | 21,8 | 21,800 | 0,000 |
| 1000 | 3,0000 | 25,1 | 25,100 | 0,000 |
| 100 | 2,0000 | 28,4 | 28,400 | 0,000 |
Fonctionnement de ce calculateur de courbe standard
Saisissez la quantité de matrice et le Ct/Cq mesuré pour chaque standard. Le calculateur prend le log₁₀ de chaque quantité de matrice positive, ajuste une droite par la méthode des moindres carrés ordinaires, puis en déduit l'efficacité d'amplification à partir de sa pente. Contrairement à un simple outil basé uniquement sur la pente, il affiche en permanence le R², l'ordonnée à l'origine, les Ct/Cq prédits et chaque résidu, afin que vous puissiez examiner la courbe plutôt que de vous fier à un seul pourcentage.
Méthode de travail utile
Planifiez vos standards avec le calculateur de dilution en série, convertissez la concentration d'ADN en copies moléculaires si nécessaire, puis collez ici la série de standards mesurée. Gardez des unités cohérentes pour toutes les quantités de matrice.
FAQ
Comment l'efficacité qPCR est-elle calculée à partir de la pente ?
L'efficacité se calcule ainsi : (10^(-1/pente)-1)×100 %. Une pente proche de -3,322 correspond à une efficacité d'amplification d'environ 100 %.
Puis-je calculer la pente et le R² à partir de ma série de dilutions ?
Oui. Collez au moins trois couples quantité de matrice / Ct/Cq. Le calculateur applique un logarithme en base 10 aux quantités de matrice positives, puis ajuste Ct/Cq en fonction de log10(quantité de matrice) par la méthode des moindres carrés ordinaires.
Pourquoi afficher les résidus ?
Les résidus indiquent l'écart entre chaque valeur Ct/Cq mesurée et la courbe standard ajustée, ce qui permet de repérer facilement un point de dilution inhabituel sans le masquer.