Calcolatore di biologia e laboratorio MAXScanner
Calcolatore di ligazione del DNA — Rapporto molare inserto:vettore, ng, fmol e volumi di pipettaggio
Calcola la massa di DNA dell'inserto richiesta a partire dalle lunghezze di vettore e inserto, confronta il rapporto molare effettivo inserto:vettore, converte entrambi i frammenti in femtomoli e, se desiderato, calcola i volumi di pipettaggio dalle concentrazioni delle soluzioni madre.
Risultati
Formula, esempio e ipotesi
ng inserto richiesti=ng vettore×(bp inserto/bp vettore)×rapporto target; fmol dsDNA=ng×10⁶/(bp×660).
Con 50 ng di un vettore da 3.000 bp e un inserto da 1.000 bp, un rapporto molare target di 3:1 richiede 50 ng di inserto.
- L'equazione del rapporto di massa presuppone che entrambi i frammenti siano DNA a doppio filamento.
- Un rapporto molare utile dipende dalla chimica dell'assemblaggio, dal tipo di estremità, dal disegno dei frammenti e dal protocollo; il calcolatore riporta il calcolo aritmetico e non prescrive una condizione di laboratorio.
Domande frequenti
Perché usare un rapporto molare invece di una massa di DNA uguale?
La ligazione unisce molecole. A parità di massa, i frammenti corti contengono più molecole di quelli lunghi, quindi la lunghezza del frammento va inclusa nel calcolo.
Questo calcolatore può calcolare i volumi di pipettaggio?
Sì. Inserisci le concentrazioni delle soluzioni madre di vettore e inserto per convertire le quantità calcolate in nanogrammi in microlitri.