MAXScanner 生物・実験室計算ツール
qPCR効率計算機 — 標準曲線、傾き、R²、残差
傾きからqPCRの増幅効率を計算するか、Ct/Cqとテンプレート量の完全な標準曲線を当てはめます。傾き、切片、R²、効率、増幅係数、各点の残差を求められます。
標準曲線をフィットさせる
標準試料ごとに1行: テンプレート量、Ct/Cq。量はコピー数、濃度、相対量のいずれでもよいが、同一の一貫した尺度で入力すること。
傾き
-3.3000増幅効率
100.9%R²
1.0000増幅率
2.009×切片
35.0000傾きから増幅効率を求める簡易計算
増幅効率
100.0%
1サイクルあたりの増幅係数
2.000×
計算式: E% = (10^(-1/傾き) - 1) × 100。品質の判定基準は測定条件に応じた目安として扱い、ご自身のプロトコルや検証基準の代わりにはしないでください。
点ごとの残差評価
| 量 | log₁₀ 量 | 実測 Ct/Cq | 予測値 | 残差 |
|---|---|---|---|---|
| 1000000 | 6.0000 | 15.2 | 15.200 | -0.000 |
| 100000 | 5.0000 | 18.5 | 18.500 | 0.000 |
| 10000 | 4.0000 | 21.8 | 21.800 | 0.000 |
| 1000 | 3.0000 | 25.1 | 25.100 | 0.000 |
| 100 | 2.0000 | 28.4 | 28.400 | 0.000 |
この標準曲線計算機の仕組み
各標準試料のテンプレート量と測定したCt/Cqを入力してください。計算機は正の各テンプレート量の log₁₀ を取り、最小二乗法で直線を当てはめ、その傾きから増幅効率を求めます。傾きだけを示す簡易ツールと異なり、R²、切片、予測Ct/Cq、すべての残差を表示するため、一つの効率の数値だけに頼らず、曲線を確認できます。
役立つ作業の流れ
段階希釈計算機で標準試料の濃度を計画し、必要に応じてDNA濃度を分子コピー数に換算してから、測定した標準系列をここに入力してください。すべてのテンプレート量で単位を統一してください。
よくある質問
傾きからqPCR効率はどのように計算されますか？
効率は (10^(-1/傾き)-1)×100% で求められます。傾きがおよそ -3.322 のとき、増幅効率はおよそ 100% に相当します。
希釈系列から傾きとR²を計算できますか？
はい。テンプレート量とCt/Cqの組を少なくとも3組入力してください。計算機は正のテンプレート量を log10 で変換し、Ct/Cqを log10(テンプレート量) に対して最小二乗法で当てはめます。
残差を表示する理由は何ですか？
残差は、測定されたCt/Cqが当てはめた標準曲線からどれだけ離れているかを示します。これにより、異常な希釈点を隠さずに見つけやすくなります。